Umbrella'nın yer altındaki Hive tesisinde T-virüsü serbest kalıyor. Kızıl Kraliçe adlı süper bilgisayar, virüsün yayılmasını önlemek için tesisin giriş ve çıkışlarını kapatır. Alice ve Matt, hafızalarını kaybetmiş halde uyanır ve ne olduğunu anlamaya çalışıyor. Bir grup özel kuvvet askeriyle birlikte tesise girerler. Ancak içeride onları zombi haline gelmiş çalışanlar ve ölümcül tuzaklar bekler.
Grup, Kızıl Kraliçe'yi devre dışı bırakmaya çalışırken, virüsün etkileriyle yüzleşiyor. Alice, geçmişine dair parçaları hatırlamaya başlıyor. Matt ise kız kardeşinin başına gelenleri öğreniyor. Zamanla, Umbrella'nın karanlık sırları ortaya çıkar. Tesisin derinliklerinde, daha büyük bir tehlike onları beklemektedir. Mücadeleleri, hayatta kalma savaşı haline gelir.